Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1AQ15573 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1AQ15573 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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