Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CDSNQ15517 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDSNQ15517 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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