Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP1Q15431 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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