Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NKX1-1Q15270 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NKX1-1Q15270 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms