Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPD2Q15021 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
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