Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2CQ14957 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2CQ14957 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2CQ14957 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2CQ14957 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2CQ14957 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2CQ14957 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2CQ14957 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2CQ14957 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2CQ14957 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2CQ14957 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2CQ14957 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2CQ14957 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.2 ms