Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBM39Q14498 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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