Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BECN1Q14457 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
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