Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB33AQ14088 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB33AQ14088 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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