Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASGRF1Q13972 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RASGRF1Q13972 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASGRF1Q13972 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
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