Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR1Q13613 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR1Q13613 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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