Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRR1Q13601 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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