Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PKD2Q13563 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PKD2Q13563 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PKD2Q13563 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
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