Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEUROD1Q13562 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
NEUROD1Q13562 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
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