Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H3Q13133 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
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