Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPS1Q13098 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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