Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKRN3Q13064 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
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