Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPTFQ12830 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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