Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TROQ12816 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TROQ12816 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
TROQ12816 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TROQ12816 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TROQ12816 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TROQ12816 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TROQ12816 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TROQ12816 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TROQ12816 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TROQ12816 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TROQ12816 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TROQ12816 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TROQ12816 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TROQ12816 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TROQ12816 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
TROQ12816 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TROQ12816 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TROQ12816 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TROQ12816 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TROQ12816 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TROQ12816 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TROQ12816 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TROQ12816 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TROQ12816 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TROQ12816 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TROQ12816 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TROQ12816 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TROQ12816 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TROQ12816 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TROQ12816 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TROQ12816 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TROQ12816 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TROQ12816 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TROQ12816 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TROQ12816 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TROQ12816 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TROQ12816 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TROQ12816 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TROQ12816 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TROQ12816 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TROQ12816 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
TROQ12816 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TROQ12816 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TROQ12816 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TROQ12816 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TROQ12816 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TROQ12816 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TROQ12816 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TROQ12816 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TROQ12816 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TROQ12816 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TROQ12816 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TROQ12816 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TROQ12816 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TROQ12816 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TROQ12816 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
TROQ12816 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TROQ12816 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TROQ12816 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TROQ12816 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TROQ12816 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TROQ12816 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TROQ12816 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TROQ12816 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TROQ12816 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TROQ12816 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TROQ12816 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TROQ12816 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TROQ12816 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TROQ12816 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TROQ12816 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TROQ12816 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TROQ12816 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TROQ12816 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TROQ12816 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TROQ12816 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TROQ12816 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TROQ12816 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TROQ12816 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TROQ12816 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TROQ12816 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TROQ12816 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TROQ12816 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TROQ12816 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TROQ12816 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TROQ12816 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TROQ12816 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
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