Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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