Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.54□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YJL220WYJL220W 453 nt4.54□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 MRM1YOR201C 1239 nt4.54□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 APC1YNL172W 5247 nt4.53□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YER158CYER158C 1722 nt4.53□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 CAB3YKL088W 1716 nt4.53□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 CPR4YCR069W 957 nt4.53□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YJR012CYJR012C 624 nt4.53□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 RSA3YLR221C 663 nt4.53□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YNL134CYNL134C 1131 nt4.53□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 PCL1YNL289W 840 nt4.53□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 BBC1YJL020C 3474 nt4.53□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YEH2YLR020C 1617 nt4.53□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 MSC2YDR205W 2175 nt4.53□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 PMT4YJR143C 2289 nt4.52□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 PFK1YGR240C 2964 nt4.52□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 SPR6YER115C 576 nt4.52□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 GPP1YIL053W 753 nt4.52□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YIL165CYIL165C 360 nt4.52□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YJL215CYJL215C 360 nt4.52□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 MHO1YJR008W 1017 nt4.52□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 BUD17YNR027W 954 nt4.52□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 CIN5YOR028C 888 nt4.52□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 GAS4YOL132W 1416 nt4.52□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 SWC3YAL011W 1878 nt4.52□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 MAD3YJL013C 1548 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 EAR1YMR171C 1653 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 PRD1YCL057W 2139 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 PAH1YMR165C 2589 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YHR214WYHR214W 612 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 UBI4YLL039C 1146 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 UIP3YAR027W 708 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YAR066WYAR066W 612 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 NOP13YNL175C 1212 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 PDX3YBR035C 687 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 SPO19YPL130W 672 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 KEX1YGL203C 2190 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 HOT1YMR172W 2160 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 LAP3YNL239W 1365 nt4.51□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 SAF1YBR280C 1914 nt4.5□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 KTR7YIL085C 1554 nt4.5□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YER134CYER134C 537 nt4.5□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YIR043CYIR043C 693 nt4.5□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 RFU1YLR073C 603 nt4.5□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 RPP0YLR340W 939 nt4.5□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YGP1YNL160W 1065 nt4.5□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 ECM23YPL021W 564 nt4.5□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 CTT1YGR088W 1689 nt4.5□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 ERG4YGL012W 1422 nt4.49□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.49□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 TVP38YKR088C 1014 nt4.49□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 SRN2YLR119W 642 nt4.49□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 MRPL24YMR193W 777 nt4.49□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 PHA2YNL316C 1005 nt4.49□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 NUP2YLR335W 2163 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 THI20YOL055C 1656 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 IMA3YIL172C 1770 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 IMA4YJL221C 1770 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 MDM30YLR368W 1797 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 LYS5YGL154C 819 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 CYC1YJR048W 330 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YML119WYML119W 1074 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 RCL1YOL010W 1104 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 ICY2YPL250C 411 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 snR19snR19 568 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 MCM2YBL023C 2607 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 IMD2YHR216W 1572 nt4.48□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 ISR1YPR106W 1332 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 TYW1YPL207W 2433 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 VBA2YBR293W 1425 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YMR221CYMR221C 1515 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 SAS10YDL153C 1833 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YIL092WYIL092W 1902 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YCR006CYCR006C 474 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YDR274CYDR274C 372 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 LNP1YHR192W 837 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 YRA2YKL214C 612 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 RPS0BYLR048W 759 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 ORM2YLR350W 651 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 FBP1YLR377C 1047 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 REG2YBR050C 1017 nt4.47□□□□□ -1.69
LDB17Q12342 HOS2YGL194C 1359 nt4.46□□□□□ -1.7
LDB17Q12342 MDM34YGL219C 1380 nt4.46□□□□□ -1.7
LDB17Q12342 RNA15YGL044C 891 nt4.46□□□□□ -1.7
LDB17Q12342 NAT2YGR147C 867 nt4.46□□□□□ -1.7
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