Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 GAT3YLR013W 426 nt5.54□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 VPS68YOL129W 555 nt5.54□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YPL073CYPL073C 486 nt5.54□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 ABF1YKL112W 2196 nt5.54□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 HRR25YPL204W 1485 nt5.53□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YTA6YPL074W 2265 nt5.53□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 IRC6YFR043C 714 nt5.53□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 MRF1YGL143C 1242 nt5.53□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YGR273CYGR273C 525 nt5.53□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 RPF2YKR081C 1035 nt5.53□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 CDA2YLR308W 939 nt5.53□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 SPO20YMR017W 1194 nt5.53□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 OSW1YOR255W 837 nt5.53□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 PRM4YPL156C 855 nt5.53□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 DOA1YKL213C 2148 nt5.53□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 HXT14YNL318C 1623 nt5.52□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 SCM3YDL139C 672 nt5.52□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YDR124WYDR124W 975 nt5.52□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YLR124WYLR124W 345 nt5.52□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YML090WYML090W 387 nt5.52□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 MGR2YPL098C 342 nt5.52□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 NRG2YBR066C 663 nt5.52□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 MDM10YAL010C 1482 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 HXT4YHR092C 1731 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 CUE2YKL090W 1332 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 HES1YOR237W 1305 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YPK3YBR028C 1578 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YDL109CYDL109C 1944 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 SEC28YIL076W 891 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 RPS0BYLR048W 759 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 MRPL39YML009C 213 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 ROT1YMR200W 771 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 COX11YPL132W 903 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YPL199CYPL199C 723 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 NHP6AYPR052C 282 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 ALG2YGL065C 1512 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 RAD57YDR004W 1383 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 BIT2YBR270C 1638 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 TFG1YGR186W 2208 nt5.51□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YDL027CYDL027C 1263 nt5.5□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 PFA5YDR459C 1125 nt5.5□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt5.5□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YIM2YMR151W 438 nt5.5□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YOL166CYOL166C 339 nt5.5□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 DNF2YDR093W 4839 nt5.5□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 HIR2YOR038C 2628 nt5.5□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 MMT2YPL224C 1455 nt5.5□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 SFI1YLL003W 2841 nt5.5□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 FRE3YOR381W 2136 nt5.5□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 RRI1YDL216C 1323 nt5.49□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YAP1802YGR241C 1707 nt5.49□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt5.49□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YJL220WYJL220W 453 nt5.49□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 ELF1YKL160W 438 nt5.49□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 LIP2YLR239C 987 nt5.49□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 SSU72YNL222W 621 nt5.49□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 SUT2YPR009W 807 nt5.49□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 EFM2YBR271W 1260 nt5.49□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 DEG1YFL001W 1329 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 KAR5YMR065W 1515 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 BUD7YOR299W 2241 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 PRM1YNL279W 1986 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 BUD22YMR014W 1560 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 ENT5YDR153C 1236 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YER187WYER187W 426 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 TRX2YGR209C 315 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 HYM1YKL189W 1200 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 RPS31YLR167W 459 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 APS1YLR170C 471 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 SEC65YML105C 822 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 HLJ1YMR161W 675 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 snR189snR189 189 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 MSE1YOL033W 1611 nt5.48□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 MOB2YFL034C-B 864 nt5.47□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 DCG1YIR030C 735 nt5.47□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YLR366WYLR366W 306 nt5.47□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YMR178WYMR178W 825 nt5.47□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YNL174WYNL174W 573 nt5.47□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 YNL226WYNL226W 411 nt5.47□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 snR10snR10 245 nt5.47□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 ZPS1YOL154W 750 nt5.47□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 TSL1YML100W 3297 nt5.47□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 EKI1YDR147W 1605 nt5.47□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 BRE2YLR015W 1518 nt5.47□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 MPH2YDL247W 1830 nt5.46□□□□□ -1.53
CLF1Q12309 AIM10YER087W 1731 nt5.46□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 THI22YPR121W 1719 nt5.46□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YGR016WYGR016W 573 nt5.46□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 AIR1YIL079C 1083 nt5.46□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 PRM9YAR031W 897 nt5.46□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YLR225CYLR225C 1224 nt5.46□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 SNO1YMR095C 675 nt5.46□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 THI80YOR143C 960 nt5.46□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 RPN8YOR261C 1017 nt5.46□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YPL191CYPL191C 1083 nt5.46□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 PRP9YDL030W 1593 nt5.46□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 SLT2YHR030C 1455 nt5.45□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 MOT2YER068W 1764 nt5.45□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 SEO1YAL067C 1782 nt5.45□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 SUR2YDR297W 1050 nt5.45□□□□□ -1.54
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