Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 YGR079WYGR079W 1113 nt4.59□□□□□ -1.67
RPN5Q12250 YNG2YHR090C 849 nt4.59□□□□□ -1.67
RPN5Q12250 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt4.59□□□□□ -1.67
RPN5Q12250 CAF4YKR036C 1932 nt4.59□□□□□ -1.67
RPN5Q12250 EMP46YLR080W 1335 nt4.59□□□□□ -1.67
RPN5Q12250 SUL2YLR092W 2682 nt4.59□□□□□ -1.67
RPN5Q12250 YLR283WYLR283W 945 nt4.59□□□□□ -1.67
RPN5Q12250 HRR25YPL204W 1485 nt4.59□□□□□ -1.67
RPN5Q12250 YCL012CYCL012C 405 nt4.59□□□□□ -1.67
RPN5Q12250 KEX1YGL203C 2190 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 ABF1YKL112W 2196 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 MSE1YOL033W 1611 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 DRN1YGR093W 1524 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 ELO3YLR372W 1038 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 YLR374CYLR374C 390 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 SET6YPL165C 1122 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 SSO1YPL232W 873 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 KRE6YPR159W 2163 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 OAF1YAL051W 3144 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 KAR2YJL034W 2049 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 SNF2YOR290C 5112 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 ORC6YHR118C 1308 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 RPL34AYER056C-A 366 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 YIL152WYIL152W 708 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 RFC2YJR068W 1062 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 YET2YMR040W 483 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 GSP2YOR185C 663 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 CKS1YBR135W 453 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 SEG2YKL105C 3399 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 SWC3YAL011W 1878 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 CDC9YDL164C 2268 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 HOT1YMR172W 2160 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 BBC1YJL020C 3474 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 YAP1802YGR241C 1707 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 YGR015CYGR015C 987 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 PEX22YAL055W 543 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 RFU1YLR073C 603 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 MFA2YNL145W 117 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 MAP2YBL091C 1266 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 HSP26YBR072W 645 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 ATG14YBR128C 1035 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 AXL2YIL140W 2472 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 TFA1YKL028W 1449 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 FMP30YPL103C 1407 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 RVB1YDR190C 1392 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 MIF2YKL089W 1650 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 LPP1YDR503C 825 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 LDB18YLL049W 540 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 MFM1YPL060W 1242 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 RRP3YHR065C 1506 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 TPO2YGR138C 1845 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 YGR266WYGR266W 2106 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 SOF1YLL011W 1470 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 SYP1YCR030C 2613 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 MNT2YGL257C 1677 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 ENT1YDL161W 1365 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 PRO2YOR323C 1371 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 YCR050CYCR050C 309 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 ARO2YGL148W 1131 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 SUT1YGL162W 900 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 YHL049CYHL049C 816 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 FMP33YJL161W 543 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 YRA2YKL214C 612 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 RAD30YDR419W 1899 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 PCL9YDL179W 915 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 NAT2YGR147C 867 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 SNL1YIL016W 480 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 CTT1YGR088W 1689 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 SUP35YDR172W 2058 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 ADY3YDL239C 2373 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN5Q12250 HRK1YOR267C 2280 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 GMC1YDR506C 1827 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 COS7YDL248W 1152 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 CAB1YDR531W 1104 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 VPS29YHR012W 849 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 COS5YJR161C 1152 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 VTA1YLR181C 993 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 YPL071CYPL071C 471 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 MAK3YPR051W 531 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 RRB1YMR131C 1536 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 TFC7YOR110W 1308 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 MDR1YGR100W 2853 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 ORM2YLR350W 651 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 MRP21YBL090W 534 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 BUD7YOR299W 2241 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 MPC54YOR177C 1395 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 TUB3YML124C 1338 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 TFB3YDR460W 966 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 YGL193CYGL193C 312 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 NSE1YLR007W 1011 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 SPS19YNL202W 879 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 LTO1YNL260C 597 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 AVT1YJR001W 1809 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 CDC48YDL126C 2508 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN5Q12250 THI20YOL055C 1656 nt4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms