Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms