Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms