Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A11Q08AI6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A11Q08AI6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms