Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SLFN5Q08AF3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLFN5Q08AF3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms