Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CAMSAP2Q08AD1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAMSAP2Q08AD1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms