Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 PAU17YLL025W 375 nt5.31□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 UIP3YAR027W 708 nt5.31□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 YBL081WYBL081W 1107 nt5.31□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 PGM2YMR105C 1710 nt5.31□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 MEC3YLR288C 1425 nt5.31□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 PEX29YDR479C 1665 nt5.31□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 VBA1YMR088C 1689 nt5.31□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 MPH2YDL247W 1830 nt5.3□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 YTA12YMR089C 2478 nt5.3□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 YDL228CYDL228C 642 nt5.3□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 YIL028WYIL028W 399 nt5.3□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 YJL215CYJL215C 360 nt5.3□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 ECM1YAL059W 639 nt5.3□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 MRP21YBL090W 534 nt5.3□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 PDX3YBR035C 687 nt5.3□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 BOP2YLR267W 1713 nt5.3□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 VPS36YLR417W 1701 nt5.3□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 CYK3YDL117W 2658 nt5.3□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 CRT10YOL063C 2874 nt5.3□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 FMP46YKR049C 402 nt5.29□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 YOR131CYOR131C 657 nt5.29□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 RET3YPL010W 570 nt5.29□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 APC1YNL172W 5247 nt5.29□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 AIM21YIR003W 2040 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 IBA57YJR122W 1494 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 CPR1YDR155C 489 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 RAI1YGL246C 1164 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 YGL262WYGL262W 528 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 MIC26YGR235C 702 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 YKL169CYKL169C 384 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 YET2YMR040W 483 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 PPA2YMR267W 933 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 ENV9YOR246C 993 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 snR3snR3 194 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 TFG1YGR186W 2208 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 SET4YJL105W 1683 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 NOC4YPR144C 1659 nt5.28□□□□□ -1.56
CTI6Q08923 YCR023CYCR023C 1836 nt5.27□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 COQ4YDR204W 1008 nt5.27□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 RTN1YDR233C 888 nt5.27□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 MPS3YJL019W 2049 nt5.27□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YJR096WYJR096W 849 nt5.27□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YNL143CYNL143C 393 nt5.27□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 IFM1YOL023W 2031 nt5.27□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 STE20YHL007C 2820 nt5.26□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 CWC2YDL209C 1020 nt5.26□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 GRE3YHR104W 984 nt5.26□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 TAF4YMR005W 1167 nt5.26□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 NFI1YOR156C 2181 nt5.26□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 KAP114YGL241W 3015 nt5.26□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 BUD25YER014C-A 462 nt5.25□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 RSF1YMR030W 1131 nt5.25□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 HXT7YDR342C 1713 nt5.25□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 HXT6YDR343C 1713 nt5.25□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 SUL2YLR092W 2682 nt5.25□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 ADP1YCR011C 3150 nt5.24□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YDR445CYDR445C 408 nt5.24□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt5.24□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 RHO3YIL118W 696 nt5.24□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YLR402WYLR402W 192 nt5.24□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 COG5YNL051W 1212 nt5.24□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt5.24□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 AIM41YOR215C 558 nt5.24□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 RMI1YPL024W 726 nt5.24□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 MAK3YPR051W 531 nt5.24□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 TAF5YBR198C 2397 nt5.24□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 FKH1YIL131C 1455 nt5.24□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 GCR1YPL075W 2358 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 PDR15YDR406W 4590 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 API2YDR525W 330 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 BUR6YER159C 429 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YGL118CYGL118C 438 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 LSO1YJR005C-A 282 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 PSR1YLL010C 1284 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YML031C-AYML031C-A 336 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 PDR16YNL231C 1056 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YPL073CYPL073C 486 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 RSM23YGL129C 1353 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 TIP20YGL145W 2106 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YMR221CYMR221C 1515 nt5.23□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 VHC1YBR235W 3363 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 MSC2YDR205W 2175 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 KRE29YER038C 1395 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 OCA4YCR095C 1089 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 LHP1YDL051W 828 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YDR161WYDR161W 1164 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 COX4YGL187C 468 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 NTR2YKR022C 969 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YLR124WYLR124W 345 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YPL162CYPL162C 822 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 YPR059CYPR059C 387 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 ISA2YPR067W 558 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 RAD28YDR030C 1521 nt5.22□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 EUG1YDR518W 1554 nt5.21□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 MCX1YBR227C 1563 nt5.21□□□□□ -1.57
CTI6Q08923 PCL8YPL219W 1479 nt5.21□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 YDL183CYDL183C 963 nt5.21□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 ARC1YGL105W 1131 nt5.21□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 NKP2YLR315W 462 nt5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.6 ms