Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF4Q08170 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms