Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CXCL9Q07325 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCL9Q07325 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms