Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1T1Q06455 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms