Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCDQ05655 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCDQ05655 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms