Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACVR1Q04771 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1Q04771 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms