Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPARDQ03181 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms