Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLH2Q02577 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms