Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF9Q00978 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms