Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMAD3P84022 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms