Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIM1P81133 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIM1P81133 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIM1P81133 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIM1P81133 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIM1P81133 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIM1P81133 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIM1P81133 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIM1P81133 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIM1P81133 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIM1P81133 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIM1P81133 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIM1P81133 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIM1P81133 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIM1P81133 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIM1P81133 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIM1P81133 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIM1P81133 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIM1P81133 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIM1P81133 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIM1P81133 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIM1P81133 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIM1P81133 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIM1P81133 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIM1P81133 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIM1P81133 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIM1P81133 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIM1P81133 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIM1P81133 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIM1P81133 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIM1P81133 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIM1P81133 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIM1P81133 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIM1P81133 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIM1P81133 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIM1P81133 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIM1P81133 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIM1P81133 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIM1P81133 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIM1P81133 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIM1P81133 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIM1P81133 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIM1P81133 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIM1P81133 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIM1P81133 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIM1P81133 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIM1P81133 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIM1P81133 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIM1P81133 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIM1P81133 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIM1P81133 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms