Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX1P78414 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX1P78414 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX1P78414 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX1P78414 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX1P78414 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX1P78414 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX1P78414 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX1P78414 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX1P78414 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX1P78414 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX1P78414 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX1P78414 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX1P78414 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX1P78414 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX1P78414 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX1P78414 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX1P78414 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX1P78414 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IRX1P78414 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
IRX1P78414 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IRX1P78414 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IRX1P78414 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX1P78414 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX1P78414 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX1P78414 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX1P78414 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX1P78414 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX1P78414 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX1P78414 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX1P78414 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX1P78414 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX1P78414 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX1P78414 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX1P78414 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX1P78414 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX1P78414 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX1P78414 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX1P78414 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX1P78414 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX1P78414 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX1P78414 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX1P78414 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX1P78414 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX1P78414 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX1P78414 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX1P78414 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX1P78414 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX1P78414 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX1P78414 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX1P78414 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX1P78414 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX1P78414 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX1P78414 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX1P78414 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX1P78414 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX1P78414 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX1P78414 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX1P78414 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX1P78414 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX1P78414 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX1P78414 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX1P78414 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms