Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTG1P63261 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTG1P63261 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTG1P63261 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTG1P63261 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTG1P63261 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTG1P63261 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTG1P63261 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTG1P63261 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms