Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms