Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPS1P60891 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms