Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVFRD-1P60508 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms