Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX10P56693 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX10P56693 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX10P56693 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX10P56693 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX10P56693 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX10P56693 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX10P56693 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX10P56693 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SOX10P56693 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX10P56693 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SOX10P56693 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX10P56693 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX10P56693 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX10P56693 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX10P56693 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX10P56693 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX10P56693 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX10P56693 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX10P56693 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX10P56693 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX10P56693 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX10P56693 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX10P56693 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX10P56693 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX10P56693 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX10P56693 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX10P56693 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX10P56693 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX10P56693 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX10P56693 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX10P56693 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX10P56693 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX10P56693 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX10P56693 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX10P56693 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX10P56693 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX10P56693 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX10P56693 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX10P56693 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX10P56693 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX10P56693 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX10P56693 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX10P56693 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX10P56693 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX10P56693 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX10P56693 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX10P56693 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX10P56693 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX10P56693 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX10P56693 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOX10P56693 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOX10P56693 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX10P56693 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX10P56693 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX10P56693 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX10P56693 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX10P56693 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX10P56693 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX10P56693 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX10P56693 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms