Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP1S2P56377 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP1S2P56377 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms