Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BGRP55822 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BGRP55822 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BGRP55822 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BGRP55822 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BGRP55822 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BGRP55822 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BGRP55822 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BGRP55822 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BGRP55822 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BGRP55822 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRP55822 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BGRP55822 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms