Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL23P55773 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL23P55773 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL23P55773 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL23P55773 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL23P55773 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL23P55773 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL23P55773 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL23P55773 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL23P55773 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL23P55773 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL23P55773 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL23P55773 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL23P55773 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL23P55773 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL23P55773 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL23P55773 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL23P55773 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL23P55773 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL23P55773 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL23P55773 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL23P55773 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL23P55773 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL23P55773 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL23P55773 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL23P55773 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL23P55773 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL23P55773 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL23P55773 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL23P55773 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL23P55773 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL23P55773 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL23P55773 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL23P55773 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL23P55773 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCL23P55773 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCL23P55773 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCL23P55773 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL23P55773 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL23P55773 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL23P55773 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL23P55773 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL23P55773 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL23P55773 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL23P55773 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL23P55773 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL23P55773 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL23P55773 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL23P55773 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL23P55773 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL23P55773 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL23P55773 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL23P55773 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL23P55773 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL23P55773 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL23P55773 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL23P55773 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL23P55773 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL23P55773 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL23P55773 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCL23P55773 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms