Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELLP55199 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELLP55199 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELLP55199 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELLP55199 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELLP55199 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELLP55199 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELLP55199 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELLP55199 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELLP55199 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELLP55199 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELLP55199 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELLP55199 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELLP55199 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELLP55199 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELLP55199 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELLP55199 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELLP55199 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELLP55199 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms