Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AQP4P55087 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AQP4P55087 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AQP4P55087 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AQP4P55087 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AQP4P55087 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AQP4P55087 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AQP4P55087 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AQP4P55087 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AQP4P55087 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AQP4P55087 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AQP4P55087 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AQP4P55087 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AQP4P55087 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AQP4P55087 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AQP4P55087 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AQP4P55087 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AQP4P55087 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AQP4P55087 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AQP4P55087 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AQP4P55087 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AQP4P55087 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AQP4P55087 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AQP4P55087 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AQP4P55087 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AQP4P55087 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AQP4P55087 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AQP4P55087 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AQP4P55087 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AQP4P55087 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AQP4P55087 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AQP4P55087 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AQP4P55087 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AQP4P55087 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AQP4P55087 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AQP4P55087 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AQP4P55087 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AQP4P55087 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AQP4P55087 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AQP4P55087 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AQP4P55087 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms